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白酒窖泥細菌群分析

返回列表 來源:未知 發(fā)布日期:2020-04-07 09:34【

1 材料與方法


窖泥樣品:取自川南某白酒廠3個同期建造車間中的 9口窖池,且窖池連續(xù)生產10年以上,取樣部位為每口窖底 中心部位,取得窖泥樣品后將其編號為1~9,其中1~3、 4~6、8~9為分別同一車間不同窖池窖泥。DK-S28恒溫水浴鍋:上海一恒科學儀器有限公司; SORVALL Stratos高速冷凍離心機、Thermo 900超低溫冰箱: 美國Thermo Scientific公司;TGL-16G臺式高速離心機:上海實驗儀器廠有限公司;Minisubcell水平電泳儀、GelDoc 2000凝膠成像系統(tǒng)、MyCycler PCR儀:美國Bio-Rad公司;D-160均質機:美國Scilogex公司;GS junior高通量測序儀: 美國Roche公司;Cary Eclipse熒光分光光度計:安捷倫科技 (中國)有限公司。


2 結果與分析


以9個窖泥樣品的DNA為模板,采用帶有特殊標簽的 引物進行PCR擴增,PCR擴增產物經純化后,以其為模板進 行emPCR擴增,emPCR擴增產物堿基長度在450 bp左右。 采用高通量測序技術對emPCR擴增產物進行測序,通過標 簽信息區(qū)分不同樣品。本次測序共獲得298 405條序列,序 列堿基平均長度為321 bp,大部分序列的堿基長度集中在450 bp左右,序列堿基長度與實驗設計堿基長度基本一致。經過Cope V1.2.3.3 軟件篩選過濾掉低質量序列和重復序列,最終獲得有效序 列66 322條,有效序列的堿基長度在450 bp左右。


3 結論 


主要通過高通量測序法分析了濃香型白酒不 同窖泥樣品中的細菌群落結構。通過高通量測序共獲得 66 322條有效序列,2 050個OTU。其中窖泥樣品1、2、3平均 獲得351個OTU,窖泥樣品4、5、6平均獲得214個OTU,窖泥 樣品7、8、9平均獲得153個OTU。根據(jù)OTU,9個不同窖泥 樣品中共分為9個門類,其中窖泥樣品1、2、3中共有6個門 類,窖泥樣品4、5、6中共有9個門類,窖泥樣品7、8、9中共有 8個門類。






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